导航篇

一架编号为627的国际航班从德国汉堡飞往美国波士顿，当飞机在波士顿洛根国际机场降落时，机上已没有生命迹象。所有147名乘客和机组人员都离奇恐怖地死亡。 FBI特工Phillip Broyles (Lance Reddick) 奉命赴现场展开调查。Phillip Broyles叫来了波士顿当地的FBI联络官Olivia Dunham（澳大利亚演员Anna Torv）和她的行动小组－－包括外表冷漠但是聪明绝顶的特工Charlie Francis (Kirk Acevedo)，Olivia的女助手Astrid Farnsworth (Jasika Nicole) 以及Olivia的搭挡兼秘密情人John Scott（Mark Valley, "Boston Legal"）。Phillip Broyles和Olivia曾有一段不愉快的过去，为了合作破案，两人唯有暂把嫌隙放在一边。根据Phillip Broyles获悉的情报，几名中东人将在附近的一架仓库里交换可疑公文箱。Olivia和John很快以”奇迹般的速度”找到了他们要找的人，而且”机缘巧合”地发现了一个秘密的临时实验室（毕竟是电视剧，很多细节是不能去推敲的……）。对方在逃跑中引爆了早已布置好的炸弹，John身受重伤，陷入昏迷，眼看生命垂危。更糟的是，爆炸释放了一种不稳定的化学混合物，让John的皮肤和肌肉变成水晶状－－他逐渐成了一个”透明人”。这种情况如果继续恶化下去，他几天后就会没命。 绝望的Olivia拼命寻求解救之道，她在一大堆FBI文件中发现：John的情况和天才科学家Walter Bishop博士（John Noble）所从事的研究颇为相似。尽管Bishop博士被称作”当代的爱因斯坦”，并且在前缘科技方面颇有建树，但他自己也有麻烦：17年前，自从他的实验室助手死于一次意外事故后，人们开始怀疑他非法进行人体实验，并觉得他的脑子不正常，把他关进了精神病院。Olivia赶到精神病院，却被告知只有Bishop博士的儿子Peter (Joshua Jackson) 才有资格探视他。Peter虽然智商190，比传说中爱因斯坦的智商还要高25（165），但却整天吊儿郎当，没有固定职业，道德标准也很低。他最近惹了一屁股赌债，一口气逃到了伊拉克首都巴格达……Olivia风尘仆仆地找到Peter，又带着Peter去见他多年都没有探望过的父亲……儿子不愿意与父亲和解，父亲也不愿意重回凡尘俗世，而Olivia更不愿意充当两人的”保姆”，但三人最终还是”组成”了一个奇异的调查小组。