名侦探柯南2013：远海的侦探

薄雾笼罩的京都，一起攸关国家安危的大事件发生。一艘疑似装载爆炸物的可疑船只靠近舞鹤湾。通过对船上相关数据和零部件的勘察判明，该船很大可能来自海外。此消息一出，立刻引起日本上下的恐慌。 就在同一天，江户川柯南（高山南 配音）、毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的各位一同观摩海上自卫队组织的对空作战演习，他们更史无前例地登上了宙斯盾战舰出海冒险。谁知演习中突发意外，原本的虚拟作战瞬间演变成真枪实弹的杀戮。种种不安与猜测在小兰和少年侦探们的心中蔓延。另一方面，自卫队迅速冷静地稳定事态，但始终不能探明敌人的正体和他们的目标。就在此时，战舰上发现了一条自卫队员的左臂，其配戴的手表指针停止在5:30 AM。接二连三的异常事件，迫使大阪府的警方乘坐直升机赶来，与京都当地的同侪协作展开调查。在此期间，神秘的女性自卫队员藤井七海（柴崎幸 配音）也登上了宙斯盾。 柯南通过随身携带的装备与灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）取得联系，此外更得到服部平次（堀川亮 配音）和远山和叶（宫村优子 配音）的协助。最强侦探团全方位通力合作，终于发现了这一系列事件背后的始作俑者——现已秘密潜入军舰内的某国间谍X。在此期间，平次和小兰等人的生命相继受到威胁。 X到底有何目的？他的真实身份是什么？自卫队员的左臂以及藤井七海的背后又隐藏怎样的秘密？关系到全日本安危的阴谋，此刻正有条不紊地展开。工藤新一/柯南此次能否再次守护朋友，守护全日本？！